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건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Ruminococcus sp. KGMB03662 균주의 유전체 염기서열 초안

Draft genome sequence of Ruminococcus sp. KGMB03662 isolated from healthy Korean human feces

미생물학회지 2019년 55권 3호 p.274 ~ 277
 ( Han Kook-Il ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

 ( Kang Se-Won ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Eom Mi-Kyung ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김지선 ( Kim Ji-Sun ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이근철 ( Lee Keun-Chul ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김한솔 ( Kim Han-Sol ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박승환 ( Park Seung-Hwan ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Lee Ju-Huck ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박잠언 ( Park Jam-eon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Oh Byeong-Seob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
유승우 ( Ryu Seoung-Woo ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Yu Seung-Yeob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Choi Seung-Hyeon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이동호 ( Lee Dong-Ho ) - 분당서울대학교병원
 ( Yoon Hyuk ) - 분당서울대학교병원
 ( Kim Byung-Yong ) - 천랩
이제희 ( Lee Je-Hee ) - 천랩
이정숙 ( Lee Jung-Sook ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

Abstract

본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Ruminococcus sp. KGMB03662 균주를 분리하고 유전체서열을 PacBio Sequel 플랫폼을 사용하여 분석하였다. 염색체의 크기는 2,707,502 bp 로 G + C 구성 비율은 43.09%, 총 유전자수는 2,484개, 단백질 코딩 유전자는 2,367개, rRNA는 14개 및 tRNA는 53개로구성되었다. 본 유전체로부터 가수분해효소, 지방산생합성및 대사와 항생제생합성 및 내성 관련 유전자를 확인하였다.
이러한 유전체의 분석은 KGMB03662 균주가 사람의 건강 및질병에 관여할 것으로 여겨진다.

Ruminococcus sp. KGMB03662 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The whole-genome sequence of Ruminococcus sp. KGMB03662 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 2,707,502 bp chromosome with a G + C content of 43.09%, 2,484 total genes, 2,367 protein-coding gene, 14 rRNA genes, and 53 tRNA genes. In the draft genome, genes involved in the hydrolysis enzyme, fatty acid biosynthesis, fatty acid metabolite, antibiotic biosynthesis, and antibiotic resistance have been identified. Those genes of KGMB03662 may be related to the regulation of human health and disease.

키워드

Ruminococcus sp. KGMB03662; antibiotic biosynthesis; fatty acid biosynthesis; hydrolytic enzyme
원문 및 링크아웃 정보
등재저널 정보
KCI