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건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821) 균주의 유전체 염기서열 초안

Complete genome sequence of Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821) isolated from healthy Korean feces

미생물학회지 2019년 55권 3호 p.289 ~ 292
김지선 ( Kim Ji-Sun ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

 ( Kang Se-Won ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Han Kook-Il ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이근철 ( Lee Keun-Chul ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Eom Mi-Kyung ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김한솔 ( Kim Han-Sol ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Lee Ju-Huck ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박승환 ( Park Seung-Hwan ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박승환 ( Park Seung-Hwan ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박잠언 ( Park Jam-eon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Oh Byeong-Seob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Yu Seung-Yeob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Choi Seung-Hyeon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
유승우 ( Ryu Seoung-Woo ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이동호 ( Lee Dong-Ho ) - 분당서울대학교병원
 ( Yoon Hyuk ) - 분당서울대학교병원
 ( Kim Byung-Yong ) - 천랩
이제희 ( Lee Je-Hee ) - 천랩
이정숙 ( Lee Jung-Sook ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

Abstract

Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821) 은 건강한 한국인의 대변 시료로부터 분리된 Lachnospiraceae 과, Clostridia 강, Firmicutes 문에 속하는 신속 균주이다. 본 연구에서는 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 KGMB03038 균주의 유전체를 해독하고 분석하였으며 그 결과, 47.8% G + C 함량을 가진 3,334,474 bp 길이의 완전한 하나의 유전체 컨티그를 얻었다. 이 유전체는 3,099개의 단백질 암호화 유전자와12개의 rRNA 유전자, 54개의 rRNA 유전자, 그리고 4개의ncRNA 유전자를 포함하고 있다. 이 유전체 분석 결과, KGMB 03038 균주가 탄수화물의 가수화와 아미노산의 생합성에 관련되어 있는 중요 유전자들을 가지고 있음을 확인하였다.

Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821) belonging to the class Clostridia in phylum Firmicutes, was isolated from a stool sample of a healthy Korean. Herein, we report the complete genome sequence of strain KGMB03038 analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises of 3,334,474 bp with G + C content of 47.8%, which includes 3,099 predicted protein-coding genes, 12 ribosomal RNAs, 54 transfer RNAs, and 4 ncRNAs. Genome analysis revealed that strain KGMB03038 possesses a number of genes involved in hydrolysis of carbohydrates, including mono-, di-, and oligo-saccharides, and biosynthesis of various amino acids.

키워드

Lachnospiraceae; KGMB03038; carbohydrate; human feces
원문 및 링크아웃 정보
등재저널 정보
KCI