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건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주의 유전체 염기서열 초안

Draft genome sequence of Bacteroides sp. KGMB 02408 isolated from a healthy Korean feces

미생물학회지 2019년 55권 3호 p.296 ~ 299
 ( Yu Seung-Yeob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

김지선 ( Kim Ji-Sun ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Oh Byeong-Seob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
유승우 ( Ryu Seoung-Woo ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박승환 ( Park Seung-Hwan ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Kang Se-Won ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박잠언 ( Park Jam-eon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Choi Seung-Hyeon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Han Kook-Il ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이근철 ( Lee Keun-Chul ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Eom Mi-Kyung ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김한솔 ( Kim Han-Sol ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이동호 ( Lee Dong-Ho ) - 분당서울대학교병원
 ( Yoon Hyuk ) - 분당서울대학교병원
 ( Kim Byung-Yong ) - 천랩
이제희 ( Lee Je-Hee ) - 천랩
이정숙 ( Lee Jung-Sook ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Lee Ju-Huck ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

Abstract

Bacteroides 속 균주들은 척추동물의 분변 등에서 분리된것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주를 분리하였으며PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주의 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 G + C 구성 비율이 39.5%이고, 5,005개의 유전자와 rRNA 18개 tRNA 74개로 구성되었으며, 염색체의 크기는 5,771,427 bp였다. 또한, 유전체 분석 결과를 통해 산화-환원 효소와 메나퀴논 생합성 및 그와 관련된 다양한 유전자를 발견하였다.

The genus of Bacteroides has been isolated from vertebrate animal feces. Bacteroides sp. KGMB 02408 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The wholegenome sequence of Bacteroides sp. KGMB 02408 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 5,771,427 bp chromosome with a G + C content of 39.50%, 5,005 total genes, 18 rRNA genes, and 74 tRNA genes. Furthermore, we found that strain KGMB 02408 had some genes for oxidoreductases and menaquinone biosynthesis in its genome based on the result of genome analysis.

키워드

Bacteroides sp. KGMB 02408; human feces; menaquinone
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KCI