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폐수처리장의 바이오 필터로부터 분리된 Comamonas sp. NLF-7-7 균주의 유전체 염기서열 해독

Complete genome sequence of Comamonas sp. NLF-7-7 isolated from biofilter of wastewater treatment plant

미생물학회지 2019년 55권 3호 p.309 ~ 312
김동현 (  ) - 경북대학교

 ( Han Kook-Il ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
권해준 ( Kwon Hae-Jun ) - 경북대학교
김미경 ( Kim Mi-Gyeong ) - 경북대학교
김영국 ( Kim Young-Guk ) - 경북대학교
최두호 ( Choi Doo-Ho ) - 경북대학교
이근철 ( Lee Keun-Chul ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김한솔 ( Kim Han-Sol ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이정숙 ( Lee Jung-Sook ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김종국 ( Kim Jong-Guk ) - 경북대학교

Abstract

본 연구에서는 폐수처리장의 바이오필터로부터 Comamonas sp. NLF-7-7 균주를 분리하고 유전체서열을 PacBio RS II와Illumina HiSeqXten 플랫폼을 사용하여 분석하였다. 염색체의 크기는 3,333,437 bp로 G + C 구성 비율은 68.04%, 총 유전자수는 3,197개, rRNA는 9개 및 tRNA는 49개로 구성되었다.
본 유전체는 오염물질분해와 플록형성에 관여하는 황산화 경로 유전자(SoxY, SoxZ, SoxA 및 SoxB)와 플록형성 경로 유전자(EpsG, EpsE, EpsF, EpsG, EpsL 및 glycosyltransferase)를 포함하고 있다. 이러한 Comamonas sp. NLF-7-7 균주는 폐수를정화하는데 활용될 수 있다.

Comamonas sp. NLF-7-7 was isolated from biofilter of wastewater treatment plant. The whole-genome sequence of Comamonas sp. NLF-7-7 was analyzed using the PacBio RS II and Illumina HiSeqXten platform. The genome comprises a 3, 333, 437 bp chromosome with a G + C content of 68.04%, 3, 197 total genes, 9 rRNA genes, and 49 tRNA genes. This genome contained pollutants degradation and floc forming genes such as sulfur oxidization pathway (SoxY, SoxZ, SoxA, and SoxB) and floc forming pathway (EpsG, EpsE, EpsF, EpsG, EpsL, and glycosyltransferase), respectively. The Comamonas sp. NLF-7-7 can be used to the purification of wastewater.

키워드

Comamonas sp. NLF-7-7; Illumina HiSeqXten; PacBio RS II; wastewater
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