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건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Sutterella sp. KGMB03119 균주의 유전체 염기서열

Complete genome sequence of Sutterella sp. KGMB03119 isolated from healthy Korean feces

미생물학회지 2020년 56권 1호 p.65 ~ 68
유승우 ( Ryu Seoung-Woo ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

오병섭 ( Oh Byeong-Seob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
유승엽 ( Yu Seung-Yeob ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박승환 ( Park Seung-Hwan ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
강세원 ( Kang Se-Won ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김지선 ( Kim Ji-Sun ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
한국일 ( Han Kook-Il ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이근철 ( Lee Keun-Chul ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
엄미경 ( Eom Mi-Kyung ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
박잠언 ( Park Jam-Eon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
최승현 ( Choi Seung-Hyeon ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
서민국 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
서민국 ( Suh Min-Kuk ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
김한솔 ( Kim Han-Sol ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이동호 ( Lee Dong-Ho ) - 분당서울대학교병원
윤혁 ( Yoon Hyuk ) - 분당서울대학교병원
김병용 ( Kim Byung-Yong ) - 천랩
이제희 ( Lee Je-Hee ) - 천랩
이정숙 ( Lee Jung-Sook ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터
이주혁 ( Lee Ju-Huck ) - 한국생명공학연구원 생물자원센터

Abstract

Sutterella 속 균주들은 사람과 개의 분변에서 분리된 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터Sutterella sp. KGMB03119 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 Sutterella sp. KGMB03119 균주의 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 G + C 구성 비율이 58.3%이고, 염색체의 크기는 2,987,884 bp이며, 2,436개의 유전자와18개의 rRNA, 63개의 tRNA로 구성되어 있다. 또한, 유전체분석결과를 토대로 다양한 항생제 내성 유전자와 담즙산 내성관련 유전자를 가지고 있는 것을 발견하였다.

The genus of Sutterella was isolated from human and dog feces, except Sutterella wadsworthensis was isolated from human appendiceal and peritoneal fluid. Sutterella sp. KGMB03119 was isolated from healthy human feces. The whole-genome sequence of the isolate was analyzed by PacBio Sequel platform. The genome consists a 2,987,884 bp chromosome with a G + C content of 58.30%, 2,436 total genes, 18 rRNA genes and 63 tRNA genes. In addition, we found that strain KGMB03119 had several genes for antibiotic resistance and bile acid resistance in its genome based on the result of genome analysis.

키워드

Sutterella sp. KGMB03119; antibiotic resistance; bile acid resistance; human feces
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