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대한민국 낙엽송에서 분리된 버섯균 Sparassis latifolia JF02-06의 게놈 서열 초안

Draft genome sequence of cauliflower mushroom, Sparassis latifolia JF02-06, isolated from Korean larch tree

미생물학회지 2020년 56권 3호 p.315 ~ 317
Wu Yuanzheng, 김현석, 오득실, 신현재,
소속 상세정보
 ( Wu Yuanzheng ) - Chosun University Department of Biochemical and Polymer Engineering
김현석 ( Kim Hyun-Seok ) - Jeollanamdo Forest Resources Research Institute
오득실 ( Oh Deuk-Sil ) - Jeollanamdo Forest Resources Research Institute
신현재 ( Shin Hyun-Jae ) - Chosun University Department of Biochemical and Polymer Engineering

Abstract

담자균의 일종으로 꽃송이버섯으로 알려진 Sparassis latifolia JF02-06 (KACC 54766)이 전라남도 구례군의 산림지역 낙엽송에서 채집, 분리되었다. JF02-06의 게놈 서열은 Oxford nanopore sequencing과 Illumina MiSeq platform 분석을 통해 작성되었으며, 게놈 조립으로 총 크기는 39.33 Mb이고 G + C 함량은 45.74%인 103개의 스캐폴드가 생성되었다. 주석이 달린게놈 서열은 평균 유전자 길이가 1,693 bp이고 평균 엑손수가5.6인 13,038개의 단백질 코딩 유전자를 포함하고 있다. 본 S. latifolia 게놈 서열 초안은 식의약용 버섯인 Sparassis 종의 진화 분석에 중요한 데이터를 제공할 것이다.

The domestic strain of cauliflower mushroom, Sparassis latifolia JF02-06 (KACC 54766) was harvested from the larch tree of a local mountain in Jeonnam. The draft genome sequence of JF02-06 was generated by combining Oxford nanopore sequencing and Illumina MiSeq platform. Genome assembly resulted in 103 scaffolds, with a total size of 39.33 megabases (Mb) and G + C content of 45.74%. The annotated genomic sequence contains 13,038 gene models with an average gene length of 1,693 base pairs (bp) and average exon number of 5.6. Genome analysis of JF02-06 did not show much difference with S. crispa, suggesting the two strains were very close with each other. The elucidation of S. latifolia genome will provide important data for evolutionary analysis of Sparassis species.

키워드

Sparassis latifolia; cauliflower mushroom; genome sequence; Illumina MiSeq

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