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연안 해수에서 분리된 Flavobacteriaceae 균주 EG-1의 유전체 서열분석

Draft genome sequence of Flavobacteriaceae strain EG-1 isolated from coastal seawater

미생물학회지 2020년 56권 3호 p.324 ~ 326
오지성, 노동현,
소속 상세정보
오지성 ( Oh Ji-Sung ) - Chungbuk National University Department of Microbiology
노동현 ( Roh Dong-Hyun ) - Chungbuk National University Department of Microbiology

Abstract

이 연구에서는 Illumina Hiseq platform을 사용하여 연안 해수로부터 분리된 Flavobacteriaceae 균주 EG-1의 유전체 염기서열 해독을 수행하였다. 그 결과, 유전체는 대략 4.45 Mbp 의 길이 및 33.5%의 G + C 함량으로 구성되었고, 전체 3,719개의 단백질 암호 유전자, 7개의 rRNA 유전자, 37개의 tRNA 유전자, 4개의 non-coding RNA 유전자 및 14개의 위유전자(pseudo gene)가 확인되었다. EG-1 균주는 다양한 생물 고분자 물질 분해 관련 유전자 및 카로테노이드 생합성 관련 유전자들을 가지고 있었고, 해양 환경에서 유기물 순환에 기여할것으로 추정된다.

The draft genome sequencing for Flavobacteriaceae strain EG-1, isolated from coastal seawater in Korea, was performed using Illumina HiSeq platform. As a result, the draft genome was comprised of a total length of approximately 4.45 Mbp with G + C content of 33.5%, and included a total of 3,719 protein-coding, 7 rRNA, 37 tRNA, 4 non-coding RNA, and 14 pseudo genes. The strain EG-1 had various biopolymer degradation-related genes and carotenoid biosynthesis related genes, and is assumed to contribute to the cycling of organic matters in the marine environment.

키워드

Flavobacteriaceae; draft genome sequence; Illumina HiSeq

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