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내건성 식물생장 촉진 균주인 Pseudomonas fluorescens DR397의 유전체 분석

Complete genome sequence of Pseudomonas fluorescens DR397, a drought tolerant plant growth-promoting rhizobacterium

미생물학회지 2020년 56권 3호 p.331 ~ 333
수스미타 다스 니슈, 현혜림, 이태권,
소속 상세정보
수스미타 다스 니슈 ( Susmita Das Nishu ) - Yonsei University Department of Environmental Engineering
현혜림 ( Hyun Hye-Rim ) - Yonsei University Department of Environmental Engineering
이태권 ( Lee Tae-Kwon ) - Yonsei University Department of Environmental Engineering

Abstract

Pseudomonas fluorescens DR397는 식물의 내건성을 향상시키는 식물 생장 촉진 균주이다. 균주는 가뭄으로 피해를 입은 콩 재배지역(강원도)에서 분리되었다. Pacific Biosciences RS II 플랫폼을 이용한 DR397 균주의 유전체 서열을 분석하였다. 유전체는 60.6%의 DNA G + C 함량, 5,667개의 유전자, 74개의 tRNA, 19개의 rRNA, 4개의 ncRNA로 구성되었으며, 염색체의 크기는 6,418,441 bp 구성되어 있다. 유전체 분석 결과 식물 내건성 향상에 도움이 되는 삼투압 조절과 식물생장촉진 관련 유전자를 다수 발견하였다.

Pseudomonas fluorescens DR397 is a potential plant growthpromoting rhizobacterium that enhances plant tolerance to drought stress. We isolated this Gram-negative, rod-shaped strain from soybean plant rhizosphere, grown in drought-prone area of Gangwon-do province and obtained the whole-genome sequence using the Pacific Biosciences (PacBio) RS II platform. The complete genome of strain DR397 comprises 6,418,441 bp, 60.6% G + C content, which include 5,667 protein-coding genes, 74 tRNAs, 19 rRNA, 4 ncRNA, and 32 pseudo genes. The genome analysis revealed osmoadaptive drought regulatory pathway and plant growth promoting genes in P. fluorescens DR397, employing symbiotic strategy to promote plant drought resistance.

키워드

Pseudomonas fluorescens; complete genome; drought tolerance; plant growth promotion

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