잠시만 기다려 주세요. 로딩중입니다.

한국 막걸리 막걸리에서 분리 한 Lactobacillus fermentum SRCM103285의 전장 유전체

Complete genome sequence of Lactobacillus fermentum SRCM103285 isolated from Korean rice wine, makgeolli

미생물학회지 2020년 56권 3호 p.337 ~ 339
강우림, 정성엽, 차인성, 조민석, 정도연, 김병용, 이제희,
소속 상세정보
강우림 ( Kang Woo-Rim ) - ChunLab Inc.
정성엽 ( Jeong Seong-Yeop ) - Microbial Institute for Fermentation Industry
차인성 ( Cha In-Seong ) - ChunLab Inc.
조민석 ( Cho Min-Seok ) - ChunLab Inc.
정도연 ( Jung Do-Youn ) - Microbial Institute for Fermentation Industry
김병용 ( Kim Byung-Yong ) - ChunLab Inc.
이제희 ( Lee Je-Hee ) - ChunLab Inc.

Abstract

Lactobacillus fermentum SRCM103285은 막걸리로부터분리되었다. SRCM103285와 유전적으로 가장 가까운 균주는L. fermentum B1 28T이며, 16S rRNA 유전자 분석에서 99.87% 일치도를 보였다. Lactobacillus fermentum SRCM103285의 유전체는 PacBio RS II 플랫폼을 사용해 분석하였다. SRCM 103285의 유전체는 1,905,587 bp의 크기로, GC 비율은 52.3% 이다. 유전체는 15개의 rRNA, 58개의 tRNA 유전자가 포함된1,864개의 단백질 코딩 유전자를 갖는 것으로 확인되었다.
SRCM103285는 최소 8개 이상의 아세트산 대사관련 유전자와 6개 이상의 알코올 내성 유전자를 보유하고 있을 것으로 추정된다.

Lactobacillus fermentum SRCM103285 was isolated from Korean rice wine, makgeolli. Here, we report the complete genome sequence of L. fermentum SRCM103285. Strain SRCM 103285 showed 99.87% of 16S rRNA gene similarity and 99.17% of OrthoANIu value with L. fermentum B1 28T. The complete genome sequence was obtained by using PacBio RS II platform. Strain SRCM103285 has single circular chromosome of 1,905,587 bp and the G + C contents is 52.3%. The genome contains 1,864 coding sequences, 15 rRNA genes, and 58 tRNA genes. There are at least five genes involved in acetate fermentation and five alcohol tolerance gene

키워드

Lactobacillus fermentum; SRCM103285; complete genome sequence; fermentation

원문 및 링크아웃 정보

등재저널 정보