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NGS Emerging Application Technology - NGS를 위한 생물정보 프레임워크를 중심으로 -

생화학분자생물학뉴스 2012년 32권 2호 p.43 ~ 53
강병철,
소속 상세정보
강병철 (  ) - (주)인실리코젠 KM사업부

Abstract

지금까지 다양한 NGS 분석 파이프라인을 확인해보았다. 소개하다시피 NGS 데이터 분석분야는 어떤 분석을 할 것인가, 내부에 활용할 생물정보 인력이 있는가, 자체 하드웨어를 구입하여 쓸 것인가 등에 따라 다양한 분석 전략이 가능하다. 자신의 연구 환경에 적합한 NGS 분석 프레임워크를 이용하는 것은 시퀀싱 업무 자체만큼이나 중요한 과정이 되어가고 있다. 마지막으로, 소프트웨어 운영환경에 관한 언급을 하고 싶다. 연구자는 직접 분석 환경을 설치하고 운영해야 하는 오픈소스 프로그램부터, 클라우드를 통해 자동으로 분석결과를 받아 볼 수 있는 서비스까지 연구환경에 맞게 자신의 분석환경을 설정할 수 있는데, 자동성과 유연성은 함께 취하기 어려운 점이 있다. 자동화된 분석서비스를 이용하면 나만의 입맛에 맛게끔 유연하기 어렵고, 유연하려면 또 자동화하기 어렵다. 이 양끝의 스펙트럼 사이에서 자신에게 적합한 분석 환경을 찾아내야 할 필요가 있다.

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